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經顱磁刺激治療儀的應用領域
目前經顱磁刺激技術得到了廣泛的使用，國內的經顱磁刺激技術達到世界先進水平，在神經心理科（抑郁癥、精分癥）、康復科、兒科（腦癱，自閉癥等）等各個方面都得到了應用。其中對抑郁癥、睡眠障礙等疾病的效果，作為一種非藥物治療在臨床取得了可喜的成績。
臨床診斷
TMS作為新的神經電生理技術，與肌電圖誘發電位儀結合新開辟的檢查項目有：
（1）運動誘發電位（MEP）是刺激運動皮質在靶肌記錄到的肌肉運動復合電位；檢查運動神經從皮質到肌肉的傳遞、傳導通路的整體同步性和完整性。
（2）中樞運動傳導時間（CMCT）
（3）運動閾值（MT），是指在靶肌記錄到大于50uV MEP時較小頭部磁刺激強度，一般靶肌常用拇指展肌，刺激部位常為C3C4區附近。反應中樞運動神經興奮性。
（4）成對刺激和皮質間的抑制和易化（ICI/ICF ）
（5）中樞靜息期（CSP）
臨床應用
TMS可以治療精神分裂癥（陰性癥狀）、抑郁癥、強迫癥、躁狂癥、創傷后應激障礙（PTSD）等精神疾病，其中對抑郁癥的治療在美國已經通過FDA的認證，效率可以高達100%。在國內廣州腦科醫院、湖南腦科醫院、上海精神衛生中心、北京安定醫院、北大六院等各大精神病醫院都開展了相關治療，并且在臨床上取得了可喜的成績。
在脊髓損傷、帕金森病（PD）、癲癇、腦卒中后康復、外周神經康復、神經性疼痛等有不錯的效果。是無創傷治療和康復領域的少有的設備。
其他領域
除了我們現有的應用之外，TMS獨特的技術優勢，使的在科研及成癮戒毒等方面都有著廣闊的空間。
目前的科研課題有：TMS與情緒、疲勞、麻醉藥物、認知研究、軀體感覺皮層、毒品、成癮性等。
